基于我国传统经济作物种植区的作物病理生理疑难问题越来越多的现象，国内科研机构早已判断土壤问题是主要原因。围绕方案落地，解决土壤问题，2019年中国农科院多位年轻科学家发起成立了北京土巴研究院，学科横跨土壤微生物学、植物营养学、植物病理学、土壤生态学和植物生理学等，其中不乏一批国外留学回国的青年专家，包括土壤生物学博士芦晓飞、微生物学博士黄亚丽、植物病理学博士凌键等。

北京土巴研究院立足于用科学手段，基于系统性创新方法，开创以病菌基因诊断，土著菌复壮，土壤菌群平衡，土壤微生物环境管理、果树营养微调技术为支柱的系统性解决思路，重点针对果树、蔬菜突出病害和生理问题，开发产品和实用落地方案。

北京土巴研究院依托国内科研工作者网络和国家试验创新平台，同时与国外有创新突破方法的土壤研究试验室和土壤生态试验室联手合作，先后签约美国先进农业生态（Aea）试验室，西班牙完美生长（Ideagro）试验室，同时与西班牙、智利、美国等多位果树专业农学家签约，针对重点果树问题，开展土壤和营养测试诊断和方案开发合作。

自2019年成立以来，北京土巴研究院先后围绕草莓、大姜、马铃薯顺利开展了病害诊断工作，2020年春开始，重点围绕优质苹果种植区开展土壤菌群检测和土壤生态检测，计划于8月份前完成对土壤生态和土传病害问题的分析诊断并开发有针对性的综合解决方案。