筑康医药2000年创立于南京，2004年更名成立第一家以“筑康”命名的公司（南京筑康药房连锁有限公司），2011年乔迁至西善桥医药产业工业园区，并组建南京筑康医药产业集团。2018年集团进行了股份制改造，搭建了母子公司制的组织架构。控股母公司为江苏筑康医药科技股份有限公司，旗下包括南京筑康医药有限公司、江苏筑康药房连锁有限公司、南京筑康润民药房连锁有限公司、南京筑康医院管理咨询有限公司、南京宁仁堂生物科技有限公司等5个子公司，以及南京筑康药房电子商务中心、话务运营中心、中药代煎代配加工服务中心。