衢州复旦研究院（注册名：衢州市复大生物医药创新研究院）是衢州市政府与复旦大学共建的生物医药研发与转化平台。研究院将依托复旦大学在生命健康领域基础研究和新药研发的人才资源和技术平台，借助衢州的区位优势及政策优势，建设集科研人才集聚、科技成果转化、创新企业孵化、创新创业人才培养和战略性新兴产业培育为一体的高端创新创业平台，努力成为创新药物的孵化器、药物研发的服务器和医药产业的加速器，推动衢州乃至长三角生物医药产业的高质量发展。衢州复旦研究院以复旦大学上海医学院为主要参与力量，由药学院牵头，协同相关学科及附属医院等为主体进行建设，充分发挥复旦大学的多学科基础研究和应用研究优势资源，主要开展创新小分子药物、生物技术药物、复杂制剂与中药产品的开发与转化，致力于打通原始创新向生产力转化的通道，推动科研创新与产业创新深度融合，构建具有影响力和竞争力的科技成果跨区域转化平台，打造校地合作区域创新共同体。